Vuonna 1988 rikollisuus rehottaa ja Yhdysvallat päättää ratkaista tilanteen muuttamalla Manhattanin saaren yhdeksi suureksi vankilaksi, joka eristetään täysin muusta maasta. Yhdeksän vuotta myöhemmin presidenttiä kuljettanut lentokone kaapataan ja se syöksyy keskelle rikollisten kansoittamaa New Yorkia. Presidentti selviää maahansyöksystä, mutta joutuu heti rikollisten vangiksi. Entinen erityisjoukkojen palkittu sotilas ja nykyinen vanki Snake Plissken pestataan vasten tahtoaan presidentin pelastajaksi. Pelissä on Yhdysvaltojen tulevaisuus ja Snaken henki.