Det är dags att återse den modiga besättningen på U.S.S. Enterprise. Inuti nebulosan blir Enterprise attackerat av en svärm av små skepp, vars sammanlagda anfall tvingar Enterprise på flykten, illa skadat, och med stora delar av besättningen tillfångatagen. Enterprise kraschar på samma planet och blir fullständigt förstört, vilket tvingar Kapten Kirk och de kvarvarande besättningsmedlemmarna att försöka frita sina kamrater.