Mafiapomo Sam (Eric Tsang) on ollut soluttautuneena Hongkongin poliisivoimissa avustajansa Mingin (Andy Lau) kautta jo kymmenen vuotta saadakseen tietää, milloin poliisi aikoo iskeä. Samaan aikaan poliisien parhaimmistoon kuuluva Wing-Yan (Tony Leung) on työskennellyt soluttautuneena mafian valtakunnassa. Epäonnistuneen huumeratsian yhteydessä he molemmat tajuavat, että heidän riveissään on kaksoisagentti. Infernal Affairs on kovaksikeitetty toimintatrilleri, jonka uudelleenfilmatisointi Martin Scorsesen ohjaama The Departed on.