Panama är inspirerad av verkliga händelser under USA:s invasion 1989. Här möter vi före detta marinkårssoldaten Becker (Cole Hauser) som på uppdrag av sin gamle chef Stark (Mel Gibson) ska slutföra ett vapenaffär under cover. Medan de navigerar genom inbördeskrigets kaos måste Becker och Stark bekämpa lönnmördare och förhandla med fienden för att slutföra sitt uppdrag och försöka ta sig hem levande.