Hämähäkkimiehen tarinasta paljastuu aivan uusia puolia elokuvassa, joka kertoo nuoren Peter Parkerin muodonmuutoksesta syrjitystä koulupojasta todelliseksi supersankariksi. Setänsä ja tätinsä kasvattama Peter löytää isälleen kuuluneen salaperäisen salkun ja ryhtyy selvittämään vanhempiensa katoamista. Jäljet johtavat isän entisen työtoverin laboratorioon, ja joutuessaan tämän alter egon kanssa törmäyskurssille, Peterin on tehtävä elämänsä mullistavia päätöksiä supervoimiensa käytöstä.