Jesse arbetar med att följa och bevaka valar på ett forskningsfartyg tillsammans med sin mentor Randolph. Forskningsarbetet stöter plötsligt på hinder när Jesse blir vän med en tioårig pojke vars far driver illegal valjakt. Späckhuggaren Willy och hans omgivning hotas än en gång, och Jesse och hans vän bestämmer sig för att sätta stopp för tjuvjakten.