Året är 2065, krig har gjort jorden obeboelig och mänsklighetens återstående överlevande skickar iväg en flotta av rymdskepp i jakt på ett nytt hem. Efter sju års resa närmar sig The Pegasus sin destination när de stöter på ett skepp som har förlist. Men snart inser besättningen att de inte är ensamma och måste kämpa för deras överlevnad - och överlevnaden av hela mänskligheten.