Andromeda uhkaa on vakuuttava kuvaus maapallon ensimmäisestä biologisesta kriisistä. Kun harhateille joutunut satelliitti törmää maahan lähellä syrjäistä kylää New Mexicossa, pelastustiimi saa selville, että kaikki kaupunkilaiset ovat joutuneet hirvittävän kuoleman uhreiksi lapsen ja vanhan kodittoman miehen salaperäistä poikkeusta lukuun ottamatta. Eloonjääneet tuodaan huippumoderniin maanalaiseen laboratorioon, jossa hämmentyneet tutkijat kamppailevat aikaa vastaan selvittääkseen tappavan, toiselta planeetalta olevan viruksen luonteen, ennen kuin se kylvää maailmanlaajuista tuhoa.