Barry anvender sine superkræfter og rejser tilbage i tiden for at ændre sin fortid. Men da han forsøger at redde sin familie, påvirker han fremtiden, og Barry sidder fast i en ny virkelighed, hvor General Zod er vendt tilbage og truer med ødelæggelse. Nu er der ingen superhelt, som kan hjælpe ham, hans eneste chance er, hvis det lykkes ham at lirke en meget anderledes Batman fri og redde en fængslet kryptonier. For at redde den verden, han er i, og for at kunne vende tilbage til sin fremtid, må han løbe for livet. Hvis han gør det ultimative offer, vil han da kunne rette op på universet?