De pizzaälskande sköldpaddorna Michelangelo, Donatello, Leonardo och Raphael är tillbaka i ett nytt halsbrytande äventyr. Superskurken Shredder har rymt och smider onda planer för att ta över världen. Nu måste bröderna slå sig samman med April O'Neil och Casey Jones för att ta upp kampen mot sina fiender och den ökände Krang.