Träffa den nya Pokémonen, Celebi, som har förmågan att resa i tiden. Vicious, den framtida ättlingen till James och Jessie i Team Rocket, reser tillbaka i tiden för att ställa till kaos och förödelse och nu gäller det för den unge Ash, Pikachu och vänner att sätta stopp för marodörens framfört. Under resans gång fortsätter Ash att utvecklas till den oövervinnlige Pokémon-tränare han blir i framtiden.