Suosikkihahmot Madagascarin Pingviinit saavat nyt oman elokuvan, joka paljastaa mihin tämä räpylänelikko – Kippari, Alokas, Rico ja Kowalski – todella pystyy, kun he tempautuvat mukaan maailmanlaajuiseen vakoojaoperaatioon. Pingviinien supervakoojatiimin on yhdistettävä voimansa Pohjoistuulen kanssa maailman pelastamiseksi... Hulvaton seikkailu maailman ympäri ihastuttaa koko perhettä!